MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_5

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009791	TAGCGA	2	12	195	206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009791	GCG	2	6	365	370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009791	CTCA	2	8	382	389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009791	A	6	6	449	454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009791	CGC	2	6	475	480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009791	C	6	6	503	508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_009791	C	6	6	749	754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_009791	CTG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009791	CAG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009791	AGG	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009791	CTC	2	6	925	930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009791	GAA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009791	ACC	2	6	985	990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009791	GGT	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009791	T	7	7	1005	1011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009791	ACG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009791	AAG	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009791	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009791	GAC	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009791	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009791	GCCGAT	2	12	1363	1374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009791	CAAA	2	8	1416	1423	75 %	0 %	0 %	25 %	157149576
23	NC_009791	A	6	6	1421	1426	100 %	0 %	0 %	0 %	157149576
24	NC_009791	ATA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009791	CATG	2	8	1534	1541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009791	TTAT	2	8	1587	1594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009791	AAC	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009791	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009791	GAC	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009791	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009791	GCTT	2	8	2076	2083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009791	GA	3	6	2093	2098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009791	TCA	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009791	TCA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009791	ATGA	2	8	2359	2366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009791	AC	4	8	2467	2474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009791	AAG	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009791	CTT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009791	GTT	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009791	CAC	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009791	GCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009791	CAA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009791	ACC	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009791	GCCA	2	8	2702	2709	25 %	0 %	25 %	50 %	157149577
45	NC_009791	T	7	7	2727	2733	0 %	100 %	0 %	0 %	157149577
46	NC_009791	GAA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149577
47	NC_009791	CAA	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149577
48	NC_009791	AC	3	6	2835	2840	50 %	0 %	0 %	50 %	157149577
49	NC_009791	CTGA	2	8	2892	2899	25 %	25 %	25 %	25 %	157149577
50	NC_009791	AACC	2	8	2921	2928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009791	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009791	ACA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009791	CGCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	157149575
54	NC_009791	TGC	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
55	NC_009791	CTG	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
56	NC_009791	TTC	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
57	NC_009791	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
58	NC_009791	CCGC	2	8	3511	3518	0 %	0 %	25 %	75 %	157149575
59	NC_009791	CAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575
60	NC_009791	TCCT	2	8	3611	3618	0 %	50 %	0 %	50 %	157149575
61	NC_009791	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
62	NC_009791	ATC	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575
63	NC_009791	TCG	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
64	NC_009791	CT	4	8	3795	3802	0 %	50 %	0 %	50 %	157149575
65	NC_009791	TTC	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
66	NC_009791	CCG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149575
67	NC_009791	GTTTC	2	10	4036	4045	0 %	60 %	20 %	20 %	157149575
68	NC_009791	CGG	2	6	4074	4079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149575
69	NC_009791	GTA	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149575
70	NC_009791	GCC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149575
71	NC_009791	CCAC	2	8	4252	4259	25 %	0 %	0 %	75 %	157149575
72	NC_009791	T	7	7	4275	4281	0 %	100 %	0 %	0 %	157149575
73	NC_009791	CGG	2	6	4337	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149575
74	NC_009791	TTC	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
75	NC_009791	CTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
76	NC_009791	CAG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149575
77	NC_009791	ATC	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575
78	NC_009791	GAC	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009791	CT	4	8	4581	4588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009791	CCA	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009791	GGC	2	6	4686	4691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009791	CGG	2	6	4707	4712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009791	CGC	2	6	4765	4770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009791	GTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009791	TCA	3	9	4822	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009791	A	6	6	4927	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009791	GC	3	6	4947	4952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009791	GCT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.